Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms