Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Ovch2-201ENSMUST00000106755 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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