Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms