Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtpreP49446 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PtpreP49446 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PtpreP49446 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PtpreP49446 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PtpreP49446 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PtpreP49446 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms