Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms