Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngap1F6SEU4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms