Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms