Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms