Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 Atad3aos-204ENSMUST00000174185 482 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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DmdP11531 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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DmdP11531 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DmdP11531 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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DmdP11531 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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DmdP11531 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms