Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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Gm20795J3QP49 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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Gm20795J3QP49 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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Gm20795J3QP49 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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Gm20795J3QP49 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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Gm20795J3QP49 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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Gm20795J3QP49 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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Gm20795J3QP49 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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Gm20795J3QP49 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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Gm20795J3QP49 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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Gm20795J3QP49 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
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