Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rpl39lQ9CQD0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rpl39lQ9CQD0 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rpl39lQ9CQD0 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rpl39lQ9CQD0 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rpl39lQ9CQD0 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rpl39lQ9CQD0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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Rpl39lQ9CQD0 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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Rpl39lQ9CQD0 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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Rpl39lQ9CQD0 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl39lQ9CQD0 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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