Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHF3Q92576 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms