Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms