Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr2iP60898 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms