Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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