Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCOLCE2Q9UKZ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms