Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp3Q9QY23 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pkp3Q9QY23 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms