Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnpy2Q9QXT0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnpy2Q9QXT0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnpy2Q9QXT0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnpy2Q9QXT0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnpy2Q9QXT0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnpy2Q9QXT0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnpy2Q9QXT0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnpy2Q9QXT0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnpy2Q9QXT0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnpy2Q9QXT0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnpy2Q9QXT0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnpy2Q9QXT0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnpy2Q9QXT0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnpy2Q9QXT0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms