Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkd2l2Q9JLG4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkd2l2Q9JLG4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2l2Q9JLG4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms