Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc4Q9ES56 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc4Q9ES56 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc4Q9ES56 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc4Q9ES56 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc4Q9ES56 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc4Q9ES56 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc4Q9ES56 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc4Q9ES56 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc4Q9ES56 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc4Q9ES56 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc4Q9ES56 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc4Q9ES56 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc4Q9ES56 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms