Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Clstn2Q9ER65 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Clstn2Q9ER65 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms