Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl4Q9DCU6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms