Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atg7Q9D906 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms