Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8Q6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8Q6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8Q6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8Q6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8Q6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8Q6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8Q6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8Q6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8Q6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8Q6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8Q6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8Q6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8Q6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8Q6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8Q6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8Q6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8Q6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8Q6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8Q6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8Q6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8Q6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8Q6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8Q6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8Q6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8Q6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8Q6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D8Q6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D8Q6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms