Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc39Q9D5Y1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms