Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U8

Cnbd2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd2Q9D5U8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnbd2Q9D5U8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cnbd2Q9D5U8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms