Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Syce1Q9D495 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms