Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D454 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D454 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D454 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D454 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D454 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D454 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D454 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D454 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D454 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D454 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D454 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D454 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D454 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D454 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D454 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D454 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D454 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D454 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D454 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D454 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D454 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D454 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D454 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D454 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D454 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D454 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D454 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D454 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D454 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D454 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D454 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D454 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D454 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D454 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D454 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D454 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D454 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D454 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D454 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D454 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D454 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D454 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D454 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D454 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D454 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D454 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D454 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9D454 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9D454 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9D454 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9D454 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9D454 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D454 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D454 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D454 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D454 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D454 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D454 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D454 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D454 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D454 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D454 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D454 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D454 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D454 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D454 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D454 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D454 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D454 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D454 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D454 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D454 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D454 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D454 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D454 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D454 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D454 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D454 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D454 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D454 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D454 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D454 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D454 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D454 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D454 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D454 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D454 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D454 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D454 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D454 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D454 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D454 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D454 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D454 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D454 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D454 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D454 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D454 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D454 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms