Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gpn3Q9D3W4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms