Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lingo1Q9D1T0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lingo1Q9D1T0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms