Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl28Q9D1B9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms