Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syf2Q9D198 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syf2Q9D198 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syf2Q9D198 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms