Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Malsu1Q9CWV0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Malsu1Q9CWV0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms