Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psma8Q9CWH6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psma8Q9CWH6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psma8Q9CWH6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psma8Q9CWH6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psma8Q9CWH6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psma8Q9CWH6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psma8Q9CWH6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psma8Q9CWH6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psma8Q9CWH6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psma8Q9CWH6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psma8Q9CWH6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psma8Q9CWH6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psma8Q9CWH6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Psma8Q9CWH6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psma8Q9CWH6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psma8Q9CWH6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms