Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NubplQ9CWD8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms