Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim26Q99PN3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms