Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH7

Slc26a5, Prestin, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a5Q99NH7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc26a5Q99NH7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc26a5Q99NH7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a5Q99NH7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms