Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PpifQ99KR7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 379.5 ms