Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Def8Q99J78 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms