Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CAMKK2Q96RR4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAMKK2Q96RR4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAMKK2Q96RR4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAMKK2Q96RR4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAMKK2Q96RR4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAMKK2Q96RR4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAMKK2Q96RR4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAMKK2Q96RR4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CAMKK2Q96RR4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CAMKK2Q96RR4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAMKK2Q96RR4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAMKK2Q96RR4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAMKK2Q96RR4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAMKK2Q96RR4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAMKK2Q96RR4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAMKK2Q96RR4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms