Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Cldn16Q925N4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cldn16Q925N4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cldn16Q925N4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cldn16Q925N4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cldn16Q925N4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn16Q925N4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn16Q925N4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn16Q925N4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn16Q925N4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn16Q925N4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cldn16Q925N4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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