Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4cQ8VCD7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4cQ8VCD7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms