Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Neil3Q8K203 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil3Q8K203 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil3Q8K203 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil3Q8K203 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil3Q8K203 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil3Q8K203 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil3Q8K203 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil3Q8K203 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil3Q8K203 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil3Q8K203 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil3Q8K203 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil3Q8K203 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Neil3Q8K203 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neil3Q8K203 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms