Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc73Q8CDM4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms