Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc15Q8C9M2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc15Q8C9M2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms