Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot2Q8C5L3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot2Q8C5L3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot2Q8C5L3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot2Q8C5L3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot2Q8C5L3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot2Q8C5L3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot2Q8C5L3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot2Q8C5L3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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