Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcgF3Q8BTQ0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms