Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cracr2bQ80ZJ8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cracr2bQ80ZJ8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms