Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPW1

Nexn, Nexilin, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NexnQ7TPW1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NexnQ7TPW1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NexnQ7TPW1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NexnQ7TPW1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NexnQ7TPW1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NexnQ7TPW1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NexnQ7TPW1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NexnQ7TPW1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NexnQ7TPW1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NexnQ7TPW1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NexnQ7TPW1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NexnQ7TPW1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NexnQ7TPW1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NexnQ7TPW1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NexnQ7TPW1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms