Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Uhrf2Q7TMI3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf2Q7TMI3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms